Для каждого нового предприятия проект СЗЗ разрабатывается вместе с предпроектной документацией и является обязательным в пакете документов на разрешение разработки плана предприятия и его строительство. Уже на этапе предпроектной документации в Проекте СЗЗ должны быть прописаны источники средств для обустройства СЗЗ и мероприятия в зоне, проводимые до начала строительства.
Для действующих предприятий с утверждённым проектом СЗЗ новая разработка требуется в случае каких-либо изменений в деятельности – реконструкции, изменении технологий, расширении производства и проч.